逐步提高，本科生考研率保持在30%左右，畢業生就業率保持在80%左右。
經過九十多年的建設與發展，學校已由初創時的單一學科，發展成為以醫學為主，醫、理、管、法、文多學科相互滲透、協調發展的醫科大學，形成了以本科教育為主的多層次人才培養體系。無論是辦學規模、辦學質量、辦學效益，還是師資隊伍、教學科研能力、管理水平在全國同類院校中均具有一定優勢。2006年，學校接受了教育部本科教學工作水平評估，被評為優秀。
學校現有第一臨床醫學院、第二臨床醫學院、汾陽學院、基礎醫學院、公共衛生學院、藥學院、法醫學院、護理學院、研究生學院、人文社會科學學院、繼續教育學院、職業技術學院等12個二級學院，晉祠學院1所獨立學院，口腔醫學系、兒科醫學系、麻醉學系、醫學影像學系、外語系、信息管理系、體育教學部、計算機教學部8個直屬系部，16所附屬醫院，100多個其他教學基地。學校設有臨床醫學（五年制、七年制）、預防醫學、法醫學、口腔醫學、醫學影像學、麻醉學、護理學、藥學、中藥學、藥物制劑、醫學檢驗、生物制藥、社會工作、信息管理與信息系統（醫藥方向）、公共事業管理（衛生事業管理方向）、英語（醫學方向）16個本科專業。其中，七年制臨床醫學專業是山西省唯一的長學制專業。
學校生理學為國家重點學科，生物學、公共衛生與預防醫學、臨床醫學3個一級學科設有博士后科研流動站，細胞生理學實驗室為省部共建教育部重點實驗室，臨床醫學、預防醫學、法醫學、藥學、護理學5個專業為國家級特色專業建設點，臨床技能實訓中心為國家級實驗教學示范中心，骨科學為國家臨床重點專科；另有10個省級重點學科、3個省重點實驗室、7個省級品牌專業、6個省級實驗教學示范中心、2個省級工程研究中心。學校是全國首批碩士學位、學士學位授權單位，山西省首批博士學位授權單位，全國臨床醫學專業碩士學位、公共衛生專業碩士學位試點單位，現有3個一級學科、37個二級學科具有博士學位授予權，5個一