新疆農業職業技術學院王牌專業排名有種子生產與經營專業、畜牧獸醫專業、園藝技術專業、農畜特產品加工專業、農村能源與環境技術專業等，具體專業名單請參考以下表格。

一、新疆農業職業技術學院王牌專業排名

雙高計劃高水平專業群建設名單：種子生產與經營、畜牧獸醫

全國職業院校裝備制造類示范專業點：農業裝備應用技術

國家示范高職院校重點建設專業：種子生產與經營專業、畜牧獸醫專業、園藝技術專業、農畜特產品加工專業、農村能源與環境技術專業

高等職業教育創新發展行動計劃（2015—2018 年）認定骨干專業：園林工程技術、電子商務、種子生產與經營、商務英語、軟件技術、農產品加工與質量檢測、商務管理、動物醫學、計算機網絡技術、會計、水利工程、藥品生產技術、園藝技術、食品加工技術、畜牧獸醫、機電一體化技術

自治區級特色專業：計算機網絡技術、農產品加工與質量檢測、化工生物技術

自治區級重點專業：農業裝備應用技術

二、新疆農業職業技術學院簡介

新疆農業職業技術學院位于新疆昌吉市，是一所舉辦高等職業教育的公辦全日制普通高等學校，學院是全國首批28所國家示范性高職院校，是新疆首批“高等職業教育與本科教育聯合培養應用本科人才”試點高校、現代學徒制試點單位、全國職業教育先進單位、全國畢業生就業典型經驗高校。
新疆農業職業技術學院前身是1958年2月創辦的昌吉州合作干部學校，2000年6月新疆維吾爾自治區人民政府批準升格為新疆農業職業技術學院。

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