楊玉良在卸任演說中稱，“我痛恨一切形式的貪污腐敗，尤其是高校當中的、知識分子的貪污腐敗……但是復旦需要發展，我們需要向前看，考慮到大局而有許多事情暫時還沒做，也有很多該做而來不及做……我相信‘人在做，天在看’，凡是貪污腐敗分子，必定無可逃遁!”楊玉良在講話中透露，自己向上級領導們做過承諾，會不動聲色地配合做好復旦校長的更替工作，但是“此時此刻，沒有必要‘不動聲色了’”，“也許三五年或者更長的時間以后，自然會有對我的正確評價”。這似乎透露出他的一些無奈。

　　被塞滿的舉報箱

　　在楊玉良突然離職前兩周，復旦大學黨委剛剛向中紀委提交了一份整改報告。“復旦大學被要求9月底上報，但報告只移送了實驗動物部幾個人的經濟問題，聽說有關部門很不滿意。”消息人士說，中紀委專項巡視組入駐復旦大學的時候，舉報箱被舉報者塞滿，“得用棍子往里面戳。”

　　在中央巡視組巡視復旦大學前，復旦大學的王正敏院士被學生王宇澄舉報學術造假、學歷造假、抄襲國外人工耳蝸技術鬧得沸沸揚揚。王宇澄曾告訴本報記者，他和其他幾位院士曾給楊玉良寫過舉報信，但沒有獲得回復。復旦大學學術委員會公布調查結果稱：王正敏的專著和院士申請材料中的確存在學術不規范問題，但不能判斷為造假。