北京雙一流大學(xué)有34所，包括北京大學(xué)、清華大學(xué)、中國人民大學(xué)、北京交通大學(xué)、北京工業(yè)大學(xué)、北京航空航天大學(xué)、北京理工大學(xué)、北京科技大學(xué)、北京化工大學(xué)、北京郵電大學(xué)、中國農(nóng)業(yè)大學(xué)、北京林業(yè)大學(xué)、北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院、北京中醫(yī)藥大學(xué)、北京師范大學(xué)、首都師范大學(xué)、北京外國語大學(xué)等。

除了上述院校，中國傳媒大學(xué)、對外經(jīng)濟(jì)貿(mào)易大學(xué)、中央財(cái)經(jīng)大學(xué)、外交學(xué)院、中國人民公安大學(xué)、北京體育大學(xué)、中央音樂學(xué)院、中國音樂學(xué)院、中央美術(shù)學(xué)院、中央戲劇學(xué)院、中央民族大學(xué)、中國政法大學(xué)、中國科學(xué)院大學(xué)、華北電力大學(xué)、中國礦業(yè)大學(xué)（北京）、中國地質(zhì)大學(xué)（北京）、中國石油大學(xué)（北京），也都是北京市的雙一流大學(xué)。

北京大學(xué)創(chuàng)辦于1898年，初名京師大學(xué)堂，是中國第一所國立綜合性大學(xué)，也是當(dāng)時(shí)中國最高教育行政機(jī)關(guān)。辛亥革命后，于1912年改為現(xiàn)名。2000年4月3日，北京大學(xué)與原北京醫(yī)科大學(xué)合并，組建了新的北京大學(xué)。原北京醫(yī)科大學(xué)的前身是國立北京醫(yī)學(xué)專門學(xué)校，創(chuàng)建于1912年10月26日。20世紀(jì)三、四十年代，學(xué)校一度名為北大學(xué)醫(yī)學(xué)院，并于1946年7月并入北京大學(xué)。1952年在全國高校院系調(diào)整中，北京大學(xué)醫(yī)學(xué)院脫離北京大學(xué)，獨(dú)立為北京醫(yī)學(xué)院。1985年更名為北京醫(yī)科大學(xué)，1996年成為國家首批“211工程”重點(diǎn)支持的醫(yī)科大學(xué)。兩校合并進(jìn)一步拓寬了北京大學(xué)的學(xué)科結(jié)構(gòu)，為促進(jìn)醫(yī)學(xué)與人文社會科學(xué)及理科的結(jié)合，改革醫(yī)學(xué)教育奠定了基礎(chǔ)。