新疆大學在新疆是第一批次招生，在省外也是第一次批次招生，所以我們通常認為新疆大學是一本大學。新疆大學現有25個學院，1個研究生院，2個教學研究部，36個黨政機關及教輔單位。

學校現有經濟學、法學、文學、歷史學、理學、工學、管理學、藝術學、哲學九個學科門類，涵蓋了高級專門人才培養和科學研究的主要領域。現有2個國家級重點學科（中國少數民族語言文學、應用數學），1個國家級重點培育學科（人口、資源與環境經濟學），3個雙一流重點建設學科（馬克思主義理論、化學、計算機科學與技術）；6個自治區級高峰學科，7個自治區高原學科，3個學科（化學學科、工程學科、材料學學科）進入ESI全球前1%；在全國第四輪學科評估中，有7個學科進入B類學科，9個學科進入C類學科。有14個博士學位授權一級學科、34個碩士學位授權一級學科，12個博士后科研流動站，18個碩士專業學位類別，是新疆高校中學位授權最多、學位授權體系最完備的高校。學校現有95個本科專業，70個本科招生專業；14個國家級一流本科專業建設點，10個省級一流本科專業建設點，10個國家專業，18個自治區緊缺人才專業，12個自治區重點專業。