沒有區別。都是國家教育部認可、頒發并承認的學歷證明，換言之，高校畢業證就是只有專科、本科、碩士研究生或者博士研究生等學歷之分，而從畢業證上并無體現民辦大學還是公辦大學之區分!

一、所有民辦高校的學歷證書國家都不承認？

不是所有民辦高校的學歷證書國家都不承認。

第一種：民辦高校招生列入國家招生計劃、通過省招辦錄取或備案。此類招生計劃可通過陽光高考信息臺查詢，也可以通過省市招辦印制的高校招生專業目錄或發給學生的報考資料查詢學校公布的專業和人數。

第二種：民辦高校計劃外招生，組織學生參加高自考，各門考試及格，可獲得國家承認學歷的自學考試畢業證書;其自考學歷可在教育部指定的學歷查詢網站上查詢。

第三種：民辦高校計劃外招生，學校自行頒發的畢業證書，屬于學習或培訓的經歷記載，國家不承認學歷。

二、獨立學院和民辦學院有哪些不同

獨立學院是本科，而民辦學院是本科、專科都有。獨立學院是按照教育部行政規章設立的，而民辦學院是按照民辦教育促進法設立的。

民辦學院有自己的校名、組織機構、師資力量和自己獨立頒發的畢業證書。但是獨立學院一般都是在某個大學名下設立的。可能會和掛名大學在同一個校園，也可能在師資量方面有共享，這是民辦學院沒有的優勢。

獨立學院畢業時，如果成績好的學生可以推薦使用掛名院校的畢業證書，但是畢業證書上可能會略有差別。但是民辦學院會有自己的畢業證書。

獨立學院因為不是公辦院校，所以一般學費都會比較貴，基本學費都在一萬以上，獨立院校大多是在本科三批招生，但是現在在很多省市都合并到本科二批招生了

三、獨立學院與民辦學院的區別

1.民辦高校是按照民辦教育促進法設立的，而獨立學院是教育部行政規章設立的。獨立學院一定是本科，而民辦高校專本科都有。
2.獨立學院的舉辦方一定是普通高校，合作方是社會力量，而民辦則只有社會力量作為舉辦者，這是區分兩者的最簡單的一點。
3.民辦就是有自己的校名，自己組織機構，自己的師資，自己的校園，自己獨立頒發畢業證書。
4.獨立學院一般設在某個大學名下。比如山西大學商務學院，海南大學三亞學院等，這些學院，可能和掛名的大學同在一個校園，也可能有師資等方面的共享和交流，而民辦學院沒有這方面的優勢。
兩者都是企業法人性質，有獨立的財政體系，自付盈虧，處于全部自費狀態。