學院具有獨立法人地位，實行董事會領導下的院長負責制，設有獨立財務；學院設有黨委，下設6個黨總支，41個黨支部；機構設置實行三級設置兩級管理，即設學院、學科部、系三級，學院、學科部兩級管理，系無行政職能。學院設有5大學科部、14個黨政機構及5個業(yè)務單位（具體詳見附件一）。

學院建院十余年，已為社會輸送八屆共計15057名畢業(yè)生，一次性就業(yè)率均達84%以上。2005年至2010年，學院就業(yè)率連續(xù)六年位居全省獨立學院首位，人才培養(yǎng)質量獲得社會好評。學院在全國大學生數學建模競賽、CCTV杯全國大學生英語競賽、全國電子設計大賽等各類比賽中獲得各種獎勵850個，其中：國家級獎356個，省級獎494個，并先后榮獲“改革開放30年中國十大品牌獨立學院”、“全國十佳獨立學院”和“江西省規(guī)范管理年先進單位”、“江西省創(chuàng)新發(fā)展年先進集體”、“全省大學生政治教育工作先進集體”、“江西省2007～2009年就業(yè)工作先進單位”、“全省教育系統(tǒng)人事人才工作先進集體”等多項榮譽。學院的辦學事跡多次被《瞭望》、《中國教育報》、江西教育電視臺等多家媒體宣傳報道。學院良好的社會形象和品牌效應已經形成。

南昌大學科技學院機構設置情況表