安徽醫科大學前身是創辦于1926年5月的上海東南醫學院。1949年底響應華東局“面向農村，走向內地”的號召，內遷安徽省，成為安徽省第一所高等醫科院校。1952 年改名為安徽醫學院。1996年6月經國家教委批準，更名為安徽醫科大學。學校位于安徽省會合肥市，占地72萬余方米，建筑總面積70余萬方米。

學校堅持規模、結構、質量、效益協調發展，教育質量不斷提高。學校的辦學定位是建設高水的教學研究型醫科大學。學校將現代著名教育家蔡元培先生為學校前身東南醫學院師生的題詞“好學力行，造就良醫”確立為校訓，弘揚“愛國愛民，獻身人類健康”的光榮傳統，秉承“興國、奉獻、仁愛”的育人理念，倡導踐行“求真、求精、求新”的校風學風。
學校現有基礎醫學院、公共衛生學院、口腔醫學院、衛生管理學院、護理學院、藥學院、人文社會科學學院、研究生學院、成人教育學院（繼續教育學院）等25個直屬教學機構。
學校擁有4所直屬附屬醫院（第一附屬醫院、第

二附屬醫院、第四附屬醫院、附屬口腔醫院??安徽省口腔醫院）、4所非直屬附屬醫院（附屬省立醫院、第三附屬醫院??合肥市第一人民醫院、附屬安慶醫院??安慶市立醫院、附屬六安醫院??六安市人民醫院）。堅持開放、合作、共贏的方針，與中國人民解放軍軍事醫學科學院建立戰略合作伙伴關系，并在解放軍北京軍區總醫院、空軍總醫院、海軍總醫院、306醫院、307醫院、新疆自治區人民醫院等建立臨床學院，目前臨床學院達39所，各專業實踐教學基地100余所，分布于安徽省各地市及北京、上海、江蘇、山東、浙江、廣東、福建、新疆等省市區。
學校設有臨床醫學（七年制）和臨床醫學（五年制）、口腔醫學、預防醫學、生物技術、護理學、衛生事業管理、藥學、中藥學、醫事法學、食品質量與安全等29個本科專業（方向）。擁有8個博士科學學位授權學科（藥理學、皮膚病與性病學、老年